Капитан Прайс залег на дно, и о нем ничего неизвестно. Капрал (да-да, уже капрал) Рамирез, штаб-сержант Фоули и сержант Данн отправляются в Афганистан, где новый пособник Макарова – представитель партии сепаратистов Омар Аль-Ахмед готов действовать. Макаров даром времени не теряет и организовывает два террористических акта – в Бостоне и Норфолке. Михаил с Иваном устраивают настоящую резню в российской армии. МакТавиш вынужден смотреть со стороны на бойню, в которой Иван и Михаил убивают бедных безоружных российских солдат (“Oh, Russians, Russians!” – название этой миссии. Кстати, игра из-за этой миссии получает рейтинг 21+, а миссия вырезается в русской, украинской белорусской и немецкой версиях игры), в том числе полковника Василивича – командира МакТавиша.

А в Северном Казахстане во всю идут бои российских и макаровских частей. Тут мы на пару секунд становимся российским солдатом и видим свою смерть от вражеской гранаты.

Тем временем Рамирез, Данн и Робертс (новый второстепенный герой) попадают в плен к Аль-Ахмеду. В допросе главный террорист участвует лично. Он убивает Робертса и собирается прикончить Данна, но тут врывается Фоули и другие рейнджеры. Аль-Ахмед сбегает по крышам, все (и сепаратисты, и рейнджеры) бросаются за ним в погоню. Но когда рейнджеры окружают Аль-Ахмеда, тот оступается (не специально, конечно, он не такой крутой как вы думаете) и падает с пятиэтажного здания головой вниз. Начальство посылает эвакуационные вертолеты, и американцы с гордостью возвращаются домой.

А Михаил и Иван убивают министра обороны РФ и решают сбросить атомную бомбу "Soviet" на Москву. Естественно, МакТавиш не может этого допустить, так что начинает погоню. Соуп встречает капитана Прайса, и вместе им удается убить Ивана. Михаил ускользает, но Макаров приказывает его убить, так как Миша слишком много знает.

Потом Прайс и Соуп возвращаются в SAS, их доброе имя восстановлено, и они начинают охоту на Макарова. Ирак, Афганистан, Рио-де-Жанейро, Россия (теперь действия не на Камчатке, а на Сахалине), Казахстан, Нигерия…и наконец, Макаров!

Британцы настигают его на конспиративной квартире в Казахстане. Там во время перестрелки Макаров совершает самоубийство.

В конце по новостям передают о том, что Иннокентий Макаров стал новым представителем партии ультранационалистов…